{"id":18211,"date":"2023-05-15T12:07:45","date_gmt":"2023-05-15T10:07:45","guid":{"rendered":"https:\/\/www.smith.care\/?page_id=18211"},"modified":"2025-11-04T15:02:09","modified_gmt":"2025-11-04T14:02:09","slug":"ueber-gemtex","status":"publish","type":"page","link":"https:\/\/www.smith.care\/de\/gemtex_mii\/ueber-gemtex\/","title":{"rendered":"\u00dcber GeMTeX"},"content":{"rendered":"

[vc_row css_animation=““ row_type=“row“ use_row_as_full_screen_section=“no“ type=“grid“ angled_section=“no“ text_align=“left“ background_image_as_pattern=“without_pattern“ z_index=““ css=“.vc_custom_1620639780558{background-color: #f5f6f6 !important;}“][vc_column][qode_elements_holder number_of_columns=“one_column“][qode_elements_holder_item advanced_animations=“no“ item_padding=“5% 0″ item_padding_480_600=“20px 0px 20px 0px“ item_padding_480=“20px 0px 20px 0px“][vc_column_text]<\/p>\n

GeMTeX \u2013 German Medical Text Corpus<\/h2>\n

[\/vc_column_text][vc_empty_space height=“15px“][vc_column_text css=“.vc_custom_1684145394877{padding-bottom: 5% !important;}“]<\/p>\n

Medizinische Texte f\u00fcr die Forschung automatisiert erschlie\u00dfen<\/h3>\n

[\/vc_column_text][vc_column_text]Im klinischen Alltag fallen gro\u00dfe Mengen an Texten wie Arztbriefe oder Befunde an, die f\u00fcr die Versorgung und die Forschung wertvolle Informationen zum Hintergrund, Verlauf und der Behandlung von Krankheiten enthalten. Programme zur automatischen Verarbeitung nat\u00fcrlicher Sprache (engl. Natural Language Processing, kurz: NLP) k\u00f6nnten auf Basis dieser Texte die Arbeit von \u00c4rztinnen und \u00c4rzten sowie Forschenden unterst\u00fctzen. Wegen fehlender Standardisierung medizinischer Freitexte kann das Potenzial dieses Datenschatzes jedoch nicht voll ausgesch\u00f6pft werden. Die Struktur und Sprache klinischer Aufzeichnungen h\u00e4ngen stark von Personen ab, die sie verfassen. Zudem unterscheidet sich die medizinische Sprache sehr von der allt\u00e4glichen und wissenschaftlichen Ausdrucksweise. Klinische Texte zeichnen sich durch Fachjargon, Pr\u00e4gnanz und Sprach\u00f6konomie aus, werden unter Zeitdruck geschrieben, sind l\u00fcckenhaft kodiert und wenig strukturiert.[\/vc_column_text][vc_empty_space height=“15px“][vc_column_text]Hier setzt die Methodenplattform GeMTeX ein: Sechs Datenintegrationszentren aus den \u00a0vier Medizininformatik-Konsortien DIFUTURE<\/a>, HiGHmed<\/a>, MIRACUM<\/a> und SMITH<\/a> steuern Daten und Methodiken bei, um medizinische Texte aus der Patientenversorgung f\u00fcr Forschungsprojekte verf\u00fcgbar zu machen. Damit soll das gr\u00f6\u00dfte medizinische Textkorpus in deutscher Sprache entstehen. Die Gesch\u00e4ftsstelle des SMITH-Konsortiums koordiniert das Projekt. Die Arbeiten in GeMTeX bauen auf den methodischen Anwendungsfall PheP<\/a>\/NLP auf, der durch das SMITH-Konsortium vom 01.01.2018 \u2013 31.05.2023 realisiert wurde.[\/vc_column_text][\/qode_elements_holder_item][\/qode_elements_holder][\/vc_column][\/vc_row][vc_row css_animation=““ row_type=“row“ use_row_as_full_screen_section=“no“ type=“grid“ angled_section=“no“ text_align=“left“ background_image_as_pattern=“without_pattern“ z_index=““ css=“.vc_custom_1620639790782{background-color: #f5f6f6 !important;background-position: center !important;background-repeat: no-repeat !important;background-size: cover !important;}“][vc_column css=“.vc_custom_1620729543205{padding-top: 0px !important;padding-right: 0px !important;padding-bottom: 0px !important;padding-left: 0px !important;background-color: #ffffff !important;}“][qode_elements_holder number_of_columns=“two_columns“][qode_elements_holder_item vertical_alignment=“middle“ advanced_animations=“no“ item_padding=“5%“][vc_single_image image=“18632″ img_size=“1000×1000″ css=“.vc_custom_1721376292664{background-color: #efefef !important;}“ qode_css_animation=““][\/qode_elements_holder_item][qode_elements_holder_item vertical_alignment=“middle“ horizontal_alignment=“left“ advanced_animations=“no“ item_padding=“2% 5% 0 5%“][vc_column_text css=“.vc_custom_1684145446079{padding-bottom: 10% !important;}“]<\/p>\n

Use Case GeMTeX<\/h3>\n

[\/vc_column_text]

<\/i><\/span><\/div>
Schaffung einer breiten Datenbasis f\u00fcr medizinische Forschungsprojekte sowie f\u00fcr KI-Modelle mit dem Ziel der klinischen Anwendung<\/h5><\/div>

<\/p><\/div><\/div><\/div>[vc_empty_space height=“15px“]

<\/i><\/span><\/div>
Umfangreiche Annotationen auf diesem Korpus \u2013 neben Basisannotationen (z. B. Diagnosen, Medikationen) auch tiefe fachbereichsspezifische Annotationen (u. a. Pathologie, Onkologie, Neurologie, Kardiologie)<\/h5><\/div>

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<\/i><\/span><\/div>
Etablierung technischer und organisatorischer Standards f\u00fcr die Abbildung von Texten und Annotationen unter Erweiterung des Kerndatensatzes der MII<\/h5><\/div>

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<\/i><\/span><\/div>
Konsortien\u00fcbergreifendes Projekt der Medizininformatik-Initiative unter Beteiligung von 17 Partnern aus Wissenschaft, IT und Versorgung<\/h5><\/div>

<\/p><\/div><\/div><\/div>[\/qode_elements_holder_item][\/qode_elements_holder][\/vc_column][\/vc_row][vc_row css_animation=““ row_type=“row“ use_row_as_full_screen_section=“no“ type=“grid“ angled_section=“no“ text_align=“left“ background_image_as_pattern=“without_pattern“ z_index=““ css=“.vc_custom_1620639850406{background-color: #f5f6f6 !important;}“][vc_column][qode_elements_holder number_of_columns=“one_column“][qode_elements_holder_item advanced_animations=“no“ item_padding=“4% 0 0 0″][vc_column_text]<\/p>\n

Eine gro\u00dfe Textsammlung deutschsprachiger medizinischer Texte aus der t\u00e4glichen Patientenversorgung entsteht<\/h4>\n

[\/vc_column_text][vc_empty_space height=“25px“][vc_column_text]Mit Hilfe von computergest\u00fctzter Verarbeitung nat\u00fcrlicher Sprache (NLP) k\u00f6nnen Machine Learning Modelle aufgebaut werden, die Informationen aus klinischen Texten automatisiert sichtbar machen.[\/vc_column_text][vc_empty_space height=“15px“][vc_column_text]Die Nutzung von NLP (Natural Language Processing, NLP) leistet damit die n\u00f6tige Vorarbeit, damit Textdokumente f\u00fcr die medizinische Forschung verwendet werden k\u00f6nnen. Der Fortschritt des klinischen NLP wird entscheidend von speziell trainierten Sprachmodellen abh\u00e4ngen, die realistische klinische Dokumente erfordern. Um das volle Potential von NLP auszusch\u00f6pfen, ist deshalb der Zugang zu gro\u00dfen Mengen an annotierten Texten aus der t\u00e4glichen Patientenversorgung notwendig.
\nAnnotierte Texte sind Dokumente, die durch systematische Anmerkungen zus\u00e4tzliche Informationen enthalten, z. B. Angaben zu Diagnosen oder Medikationen. Die Anmerkungen werden von angehenden \u00c4rztinnen und \u00c4rzten manuell \u00fcberpr\u00fcft und dienen damit als Referenz f\u00fcr die weitere Verbesserung der automatischen Annotation. Auf diese Weise strukturierte Informationen k\u00f6nnen zusammen mit vorliegenden Daten f\u00fcr Analysen sowie den Aufbau von statistischen Modellen verwendet werden.[\/vc_column_text][vc_empty_space height=“15px“][vc_column_text]Die IT-Infrastruktur, die w\u00e4hrend der Aufbau- und Vernetzungsphase der Medizininformatik-Initiative (MII)<\/a> zwischen 2018 \u00a0und 2022 aufgebaut worden ist bietet die M\u00f6glichkeit, klinische Dokumente in gro\u00dfem Umfang zug\u00e4nglich zu machen und sie mit systematischen Anmerkungen anzureichern. Die MII-Methodenplattform GeMTeX strebt damit an, die zwei wesentlichen Engp\u00e4sse bisheriger Sprachmodelle, Datenzug\u00e4nglichkeit und Datenannotation, zu l\u00f6sen.[\/vc_column_text][vc_empty_space height=“15px“][vc_column_text]Mit Einwilligung der Patientinnen und Patienten werden im Rahmen des GeMTeX-Projektes Dokumente aus elektronischen Gesundheitsakten (ePA) der sechs universit\u00e4tsmedizinischen Standorte M\u00fcnchen, Leipzig, Essen, Berlin, Dresden und Erlangen gesammelt. Mittels der Verarbeitung nat\u00fcrlicher Sprache werden die Dokumente aufbereitet und in anonymisierter Form f\u00fcr die gemeinsame Nutzung zur Verf\u00fcgung gestellt. Damit entsteht ein wertvolles Textrepertoire f\u00fcr Forschung und Entwicklung.[\/vc_column_text][\/qode_elements_holder_item][\/qode_elements_holder][\/vc_column][\/vc_row][vc_row css_animation=““ row_type=“row“ use_row_as_full_screen_section=“no“ type=“grid“ angled_section=“no“ text_align=“left“ background_image_as_pattern=“without_pattern“ z_index=““ css=“.vc_custom_1688115184553{margin-bottom: 2% !important;margin-left: % !important;background-color: #f5f6f6 !important;}“][vc_column][qode_elements_holder number_of_columns=“one_column“][qode_elements_holder_item advanced_animations=“no“ item_padding=“3% 0 0 0″ item_padding_480_600=“3% 0 10% 0″ item_padding_480=“3% 0 10% 0″][vc_column_text]<\/p>\n

Zentrale Strukturen erm\u00f6glichen eine breitfl\u00e4chige Anreicherung und Verwendung von klinischen Textdokumenten<\/h4>\n

[\/vc_column_text][vc_empty_space height=“25px“][vc_column_text]GeMTeX wird in der Umsetzung eine zentrale technische und organisatorische Struktur schaffen, um anonymisierte Texte zu sammeln und sie richtlinienkonform zur Anreicherung zu bearbeiten. Damit deckt GeMTeX ein breites Spektrum von Annotationsaufgaben ab. Diese werden erprobt, \u00fcberpr\u00fcft und in gro\u00dfem Ma\u00dfstab angewendet, um eine einzigartige Datenbank zu schaffen. KI-Modelle k\u00f6nnen damit trainiert und anschlie\u00dfend auf ihre N\u00fctzlichkeit im klinischen Alltag \u00fcberpr\u00fcft werden. Die angereicherten Textdokumente und die Modelle sollen \u00fcber die Zentralbibliothek der Medizin (ZBMED)<\/a> und das DFG-gef\u00f6rderte Projekt NFDI4Health<\/a> \u00f6ffentlich zug\u00e4nglich gemacht werden.[\/vc_column_text][vc_empty_space height=“15px“][vc_column_text css=““]Die Methodenplattform GeMTeX ist am 1. Juni 2023 gestartet und wird durch das Bundesministerium f\u00fcr Forschung, Technologie und Raumfahrt (BMFTR) bis zum 31. August 2026 mit rund sieben Millionen Euro gef\u00f6rdert.[\/vc_column_text][\/qode_elements_holder_item][\/qode_elements_holder][\/vc_column][\/vc_row][vc_row css_animation=““ row_type=“row“ use_row_as_full_screen_section=“no“ type=“grid“ angled_section=“no“ text_align=“left“ background_image_as_pattern=“without_pattern“ z_index=““ css=“.vc_custom_1674469702467{padding-bottom: 2% !important;background-color: #f5f6f6 !important;}“][vc_column css=“.vc_custom_1644578899976{background-color: #ffffff !important;}“][qode_elements_holder number_of_columns=“three_columns“][qode_elements_holder_item vertical_alignment=“top“ advanced_animations=“no“ item_padding=“5%“ item_padding_768_1024=“0″][vc_column_text]<\/p>\n

GeMTeX-Faktenblatt<\/h4>\n

[\/vc_column_text][vc_empty_space height=“15px“][vc_column_text]Stand: 02\/2024[\/vc_column_text][\/qode_elements_holder_item][qode_elements_holder_item horizontal_alignment=“center“ advanced_animations=“no“ item_padding=“5%“ item_padding_768_1024=“0″][vc_single_image image=“21423″ img_size=“200×150″ alignment=“center“ onclick=“custom_link“ img_link_target=“_blank“ qode_css_animation=““ link=“https:\/\/www.smith.care\/wp-content\/uploads\/2024\/03\/GeMTeX_Faktenblatt_DE_RGB.pdf“][vc_empty_space height=“15px“][vc_column_text]GeMTeX-Faktenblatt (Deutsch)<\/a>[\/vc_column_text][\/qode_elements_holder_item][qode_elements_holder_item horizontal_alignment=“center“ advanced_animations=“no“ item_padding=“5%“ item_padding_768_1024=“0″][vc_single_image image=“21423″ img_size=“200×150″ alignment=“center“ onclick=“custom_link“ img_link_target=“_blank“ qode_css_animation=““ link=“https:\/\/www.smith.care\/wp-content\/uploads\/2024\/03\/GeMTeX_Faktenblatt_EN_RGB.pdf“][vc_empty_space height=“15px“][vc_column_text]<\/p>\n

GeMTeX-Faktenblatt (Englisch)<\/a><\/p>\n

[\/vc_column_text][\/qode_elements_holder_item][\/qode_elements_holder][\/vc_column][\/vc_row][vc_row css_animation=““ row_type=“row“ use_row_as_full_screen_section=“no“ type=“grid“ angled_section=“no“ text_align=“left“ background_image_as_pattern=“without_pattern“ z_index=““ css=“.vc_custom_1762264706526{margin-bottom: 2% !important;background-color: #f5f6f6 !important;}“][vc_column css=“.vc_custom_1758537937420{padding-top: 2% !important;padding-right: 2% !important;padding-bottom: 1% !important;padding-left: 2% !important;background-color: #ffffff !important;}“]

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\n\t\t\t\t\t\t5 Fragen an\t\t\t\t\t<\/h3>\n\t\t\t\t\n\t\t\n\t\t\t\n\t\t\t\t<\/span>\n\t\t\t<\/span>\n\t\t<\/span>\n\t<\/a>\n\t<\/div>\n\t\t\t
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\n\t\t\t\t\t\t\t\tWie medizinische Texte f\u00fcr KI-Modelle nutzbar gemacht werden<\/a>\n\t\t\t\t\t\t\t<\/h4>\n\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t

Im Projekt GeMTeX entsteht derzeit ein gro\u00dfes deutschsprachiges Korpus klinischer Texte f\u00fcr KI und Forschung. Zwei Medizinstudentinnen sprechen im Interview \u00fcber ihre Arbeit an der Annotation klinischer Texte.<\/p>\n\t\t\t\t\t\t\t

\n\t\t\t\t\t\t\t\t7. Mai 2025\t\t\t\t\t\t\t\t\n\t\t\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t
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\n\t\t\t\t\t\t\t\t\u201eWir m\u00fcssen eine gemeinsame Sprache finden\u201c: GeMTeX_MII macht\u2018s m\u00f6glich<\/a>\n\t\t\t\t\t\t\t<\/h4>\n\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t

Wie klinische Texte f\u00fcr KI nutzbar werden, welche Herausforderungen es gibt und wie Klinik & Forschung davon profitieren, erkl\u00e4ren GeMTeX-Projektmanagerinnen Interview.<\/p>\n\t\t\t\t\t\t\t

\n\t\t\t\t\t\t\t\t29. Juni 2023\t\t\t\t\t\t\t\t\n\t\t\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t<\/div>\n\t<\/div>[\/vc_column][\/vc_row][vc_row css_animation=““ row_type=“row“ use_row_as_full_screen_section=“no“ type=“full_width“ angled_section=“no“ text_align=“left“ background_image_as_pattern=“without_pattern“][vc_column][vc_column_text]<\/p>\n

[\/vc_column_text][\/vc_column][\/vc_row][vc_row css_animation=““ row_type=“row“ use_row_as_full_screen_section=“no“ type=“grid“ angled_section=“no“ text_align=“left“ background_image_as_pattern=“without_pattern“ z_index=““ css=“.vc_custom_1677759775702{margin-top: 0px !important;margin-right: 0px !important;margin-bottom: 50px !important;margin-left: 0px !important;border-top-width: 0px !important;border-right-width: 0px !important;border-bottom-width: 0px !important;border-left-width: 0px !important;padding-top: 0px !important;padding-right: 0px !important;padding-bottom: 0px !important;padding-left: 0px !important;}“][vc_column css=“.vc_custom_1697624332191{margin-top: 0px !important;margin-right: 0px !important;margin-bottom: 0px !important;margin-left: 0px !important;border-top-width: 0px !important;border-right-width: 0px !important;border-bottom-width: 0px !important;border-left-width: 0px !important;padding-top: 0px !important;padding-right: 0px !important;padding-bottom: 5% !important;padding-left: 0px !important;background-color: #ffffff !important;}“][qode_elements_holder number_of_columns=“one_column“][qode_elements_holder_item horizontal_alignment=“left“ advanced_animations=“no“ item_padding=“5%“][vc_column_text css=“.vc_custom_1697624772184{margin-top: 0px !important;margin-right: 0px !important;margin-bottom: 0px !important;margin-left: 0px !important;border-top-width: 0px !important;border-right-width: 0px !important;border-bottom-width: 0px !important;border-left-width: 0px !important;padding-top: 0px !important;padding-right: 0px !important;padding-bottom: 0px !important;padding-left: 0px !important;}“]<\/p>\n

Beteiligte Konsortien der Medizininformatik-Initiative<\/h3>\n

[\/vc_column_text][\/qode_elements_holder_item][\/qode_elements_holder][qode_elements_holder number_of_columns=“one_column“][qode_elements_holder_item vertical_alignment=“middle“ horizontal_alignment=“center“ advanced_animations=“no“ item_padding=“0 5%“][vc_single_image image=“20361″ img_size=““ alignment=“center“ onclick=“custom_link“ img_link_target=“_blank“ qode_css_animation=““ link=“https:\/\/www.smith.care\/de\/“][\/qode_elements_holder_item][qode_elements_holder_item vertical_alignment=“middle“ horizontal_alignment=“center“ advanced_animations=“no“ item_padding=“0 5%“][vc_single_image image=“20367″ img_size=““ alignment=“center“ onclick=“custom_link“ img_link_target=“_blank“ css=““ qode_css_animation=““ link=“https:\/\/www.difuture.de\/“][\/qode_elements_holder_item][qode_elements_holder_item vertical_alignment=“middle“ horizontal_alignment=“center“ advanced_animations=“no“ item_padding=“0 5%“][vc_single_image image=“20365″ img_size=““ alignment=“center“ onclick=“custom_link“ img_link_target=“_blank“ qode_css_animation=““ link=“https:\/\/www.highmed.org\/“][\/qode_elements_holder_item][qode_elements_holder_item vertical_alignment=“top“ horizontal_alignment=“center“ advanced_animations=“no“ item_padding=“0 5%“][vc_single_image image=“20363″ img_size=““ alignment=“center“ onclick=“custom_link“ img_link_target=“_blank“ qode_css_animation=““ link=“https:\/\/www.miracum.org\/“][\/qode_elements_holder_item][\/qode_elements_holder][\/vc_column][\/vc_row]<\/p>\n<\/div>","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

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