{"id":18618,"date":"2023-06-28T10:10:43","date_gmt":"2023-06-28T08:10:43","guid":{"rendered":"https:\/\/www.smith.care\/?p=18618"},"modified":"2023-12-01T14:53:25","modified_gmt":"2023-12-01T13:53:25","slug":"gemtex-kick-off-juni-2023","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.smith.care\/de\/2023\/06\/28\/gemtex-kick-off-juni-2023\/","title":{"rendered":"Der gr\u00f6\u00dfte Datensatz aus deutschsprachigen medizinischen Texten entsteht | GeMTeX Kick-Off-Meeting in Leipzig"},"content":{"rendered":"\n

Am 20. und 21. Juni 2023 haben sich rund 40 Mitarbeitende aus dem GeMTeX-Projekt getroffen, um ihre Arbeit an der Methodenplattform der Medizininformatik-Initiative <\/a>aufzunehmen.<\/p>\n\n\n\n

Hauptziel von GeMTeX ist es, Texte aus der klinischen Versorgung wie Entlassbriefe einheitlich so aufzubereiten, dass diese von Programmen automatischer Sprachverarbeitung gelesen und f\u00fcr Anwendungen der K\u00fcnstlichen Intelligenz als Wissensbasis genutzt werden k\u00f6nnen. Damit soll aus dem GeMTeX-Projekt der gr\u00f6\u00dfte Datensatz f\u00fcr die automatisierte Sprachverarbeitung deutschsprachiger klinischer Texte hervorgehen.<\/p>\n\n\n\n

Den Kern des Textkorpus bilden die Dokumentbest\u00e4nde der Universit\u00e4tskliniken Technische Universit\u00e4t M\u00fcnchen, Essen, Charit\u00e9 Berlin, Erlangen, Dresden und Leipzig. Voraussetzung f\u00fcr den Aufbau der Textsammlung ist, dass die betreffenden Patientinnen und Patienten im Rahmen des Broad Consents der Medizininformatik-Initiative<\/a> eingewilligt haben, dass ihre klinischen Dokumente f\u00fcr Forschungszwecke genutzt werden d\u00fcrfen.<\/p>\n\n\n\n

\u201eWir sind ein offenes Projekt und wollen neben der jetzigen Projektkonstellation weitere Gruppen der deutschen Sprachverarbeitung dazu gewinnen\u201c, sagte Professor Martin Boeker, Verbundkoordinator des GeMTeX-Projekts, zur Er\u00f6ffnung der Veranstaltung. Professor Markus L\u00f6ffler, Direktor des Instituts f\u00fcr Medizinische Informatik, Statistik und Epidemiologie der Universit\u00e4t Leipzig hat die stellvertretende Verbundkoordination \u00fcbernommen.<\/p>\n\n\n\n

Im Mittelpunkt des Kick Off-Treffens standen das gegenseitige Kennenlernen und der Austausch der beteiligten Akteurinnen und Akteure. Zudem wurden relevante Vorarbeiten zur klinischen Sprachverarbeitung vorgestellt. So hat Florian Borchert vom Hasso-Plattner-Institut beispielsweise das annotierte Textkorpus \u201eGGPOnc<\/a>\u201c pr\u00e4sentiert, das aus dem Leitlinienprogramm f\u00fcr Krebserkrankungen in Kooperation mit der Deutschen Krebsgesellschaft entstanden ist.  <\/p>\n\n\n\n

Annotation \u2013 eine der gr\u00f6\u00dften Aufgaben bei GeMTeX<\/strong><\/p>\n\n\n\n

Um medizinische Freitexte aus der klinischen Dokumentation als Textkorpus f\u00fcr Programme automatischer Sprachverarbeitung nutzbar zu machen, m\u00fcssen sie zun\u00e4chst annotiert, d. h. inhaltlich markiert werden. Annotationsarbeiten bilden daher den Kern des GeMTeX-Projekts. Daf\u00fcr werden Medizinstudierende an den sechs beteiligten Standorten nach bestimmten Vorgaben medizinische Dokumente lesen und Passagen in einem Programm markieren.<\/p>\n\n\n\n

\u201eAnnotation ist eine der gr\u00f6\u00dften, wenn nicht die gr\u00f6\u00dfte Aufgabe bei GeMTeX,\u201c betonte Luise Modersohn, wissenschaftliche Mitarbeiterin im GeMTeX-Projekt. Sie hat eine Session moderiert, in der Vertreterinnen und Vertreter verschiedener medizinischer Fachgebiete wie Herz-Kreislauf oder Arzneimittelsicherheit ihre Anforderungen an die Annotation erl\u00e4utert haben.<\/p>\n\n\n\n

Dar\u00fcber hinaus hat Professor Stefan Schulz von der Medizinischen Universit\u00e4t Graz Annotationsrichtlinien vorgestellt, die im EU-Projekt AIDAVA<\/a> erarbeitet werden. Annotationsrichtlinien liefern Vorgaben f\u00fcr die einheitliche Kodierung von Textstellen in klinischen Dokumenten, damit sie sp\u00e4ter von Programmen automatischer Sprachverarbeitung gelesen werden k\u00f6nnen.<\/p>\n\n\n\n

Kooperationen f\u00fcr eine produktive Zusammenarbeit<\/strong><\/p>\n\n\n\n

Ein weiterer wichtiger Baustein des GeMTeX-Projekts ist die Software, welche die Annotationsarbeiten st\u00fctzt. Hierzu hat Dr. Richard Eckart de Castilho, wissenschaftlicher Mitarbeiter an der Technischen Universit\u00e4t Darmstadt, das Annotationswerkzeug \u201eINCEpTION<\/a>\u201c pr\u00e4sentiert. Mit INCEpTION werden an allen Standorten die Annotationsarbeiten durchgef\u00fchrt.<\/p>\n\n\n\n

Neben der Wissenschaft und Klinik ist in GeMTeX zudem die Industrie eingebunden. Die Industriepartner Averbis GmbH<\/a> und ID Information und Dokumentation im Gesundheitswesen GmbH & Co. KGaA<\/a> haben demonstriert, wie ihre Softwarel\u00f6sungen wissenschaftliche Studien unterst\u00fctzen und die Annotation effektiver gestalten k\u00f6nnen.<\/p>\n\n\n\n

Zum Abschluss des Treffens haben die Teilnehmenden dar\u00fcber diskutiert, wie die GeMTeX-Textkorpora in die Deutsche Zentralbibliothek der Medizin (ZB MED)<\/a> \u00fcbergeben werden k\u00f6nnen, damit sie nach Ende der Projektlaufzeit f\u00fcr Forschung und Versorgung zur Verf\u00fcgung stehen.<\/p>\n\n\n\n

Die erste GeMTeX-Klausurtagung findet am 20. und 21. November 2023 in M\u00fcnchen statt.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

Klinische Texte aus der Routineversorung, wie z. B. Arztbriefe, enthalten einen f\u00fcr die Forschung und Klinik sehr wertvollen Datenschatz. Das GeMTeX-Projekt hat das Ziel, diesen Datenschatz zu erschlie\u00dfen, indem Texte aus der Patientenversorgung f\u00fcr Programme automatischer Sprachverarbeitung aufbereitet werden. Mit dem Kick-Off am 20. und 21. Juni 2023 in Leipzig haben die GeMTeX-Projektmitarbeitenden ihre Arbeit aufgenommen. <\/p>\n","protected":false},"author":13,"featured_media":18619,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[1],"tags":[],"class_list":["post-18618","post","type-post","status-publish","format-standard","has-post-thumbnail","hentry","category-neuigkeiten"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.smith.care\/de\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/18618","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.smith.care\/de\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.smith.care\/de\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.smith.care\/de\/wp-json\/wp\/v2\/users\/13"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.smith.care\/de\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=18618"}],"version-history":[{"count":10,"href":"https:\/\/www.smith.care\/de\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/18618\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":20802,"href":"https:\/\/www.smith.care\/de\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/18618\/revisions\/20802"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.smith.care\/de\/wp-json\/wp\/v2\/media\/18619"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.smith.care\/de\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=18618"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.smith.care\/de\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=18618"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.smith.care\/de\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=18618"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}