{"id":2426,"date":"2020-12-14T15:38:00","date_gmt":"2020-12-14T14:38:00","guid":{"rendered":"https:\/\/www.smith.care\/?p=2426"},"modified":"2021-06-28T13:26:45","modified_gmt":"2021-06-28T11:26:45","slug":"verbesserte-analyse-von-behandlungsdaten-in-der-medizinischen-forschung","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.smith.care\/de\/2020\/12\/14\/verbesserte-analyse-von-behandlungsdaten-in-der-medizinischen-forschung\/","title":{"rendered":"Verbesserte Analyse von Behandlungsdaten in der medizinischen Forschung"},"content":{"rendered":"\n<h4 class=\"wp-block-heading\">Neue Software macht FHIR-Ressourcen zug\u00e4nglich f\u00fcr statistische Analysen<\/h4>\n\n\n\n<p><\/p>\n\n\n\n<p><strong>Das von der Medizininformatik-Initiative (MII) festgelegte Datenformat HL7 FHIR Standard eignet sich optimal f\u00fcr interoperablen Datenaustausch und \u2013speicherung. Die M\u00f6glichkeiten statistischer Auswertung sind hingegen begrenzt. Um eine verbesserte Analyse von Behandlungsdaten zu gew\u00e4hrleisten, wurde im Rahmen des MII Use Cases POLAR durch die Universit\u00e4t Leipzig und das Universit\u00e4tsklinikum Jena, die dem SMITH-Konsortium angeh\u00f6ren, die Software fhircrackr entwickelt.<\/strong><\/p>\n\n\n\n<p>Die Medizininformatik-Initiative (MII) arbeitet gemeinsam mit zahlreichen Partnern daran, routinem\u00e4\u00dfig erhobene Behandlungsdaten aus der Gesundheitsversorgung f\u00fcr die medizinische Forschung nutzbar zu machen. Hierf\u00fcr hat sich die MII auf das Datenformat HL7 FHIR Standard f\u00fcr die Umsetzung des Kerndatensatzes geeinigt. Ein Format, welches heterogene Daten interoperabel verarbeitet, d. h. nahtlos zusammenf\u00fchrt. FHIR-Daten sind optimal darauf angepasst, medizinische Daten interoperabel auszutauschen und zu speichern. F\u00fcr statistische Auswertungen eignen sie sich hingegen weniger. Der FHIR-Standard speichert die Daten in einzelnen, verschachtelten und miteinander verkn\u00fcpften Ressourcen, statt in tabellarischen Strukturen. G\u00e4ngige statistische Verfahren sind jedoch auf diese Strukturen angewiesen.<\/p>\n\n\n\n<p>Um das Problem zu l\u00f6sen, wurde im Rahmen des MII Use Cases POLAR durch die Universit\u00e4t Leipzig und das Universit\u00e4tsklinikum Jena, die dem SMITH-Konsortium angeh\u00f6ren, die Software fhircrackr entwickelt. fhircrackr erlaubt dem Nutzer, mit Hilfe der Statistiksoftware und Programmiersprache R auf einen FHIR-Server zuzugreifen und von dort Daten herunterzuladen. Die heruntergeladenen Daten k\u00f6nnen anschlie\u00dfend in Tabellenform umgewandelt und f\u00fcr eine statistische Analyse aufbereitet werden. Im Use Case POLAR, der sich mit Gesundheitsrisiken bei Patienten mit Polymedikation befasst, k\u00f6nnen so in FHIR vorliegende Medikationsdaten aus den Datenintegrationszentren (DIC) ausgeleitet und von fhircrackr in Tabellen umgewandelt werden. Auf dieser Basis sind beliebige Aggregationen der Daten m\u00f6glich.<\/p>\n\n\n\n<p>fhircrackr wurde erstmalig im Juli 2020 auf CRAN (Comprehensive R Archive Network) ver\u00f6ffentlicht. CRAN ist ein \u00f6ffentliches Online-Archiv f\u00fcr R-Pakete, das den Paket-Code testet und frei zur Verf\u00fcgung stellt. Au\u00dferdem wird fhircrackr quelloffen unter dem Softwareverwaltungsdienst Github weiterentwickelt. Als eine der ersten L\u00f6sungen zur Transformation von FHIR-Daten in Tabellen fand diese in der gesamten MII gro\u00dfen Zuspruch und wird gleicherma\u00dfen in SMITH Use Cases wie HELP und PHEP und \u00fcbergreifenden Use Cases wie POLAR und CORD zum Einsatz kommen.<\/p>\n\n\n\n<p>Fortf\u00fchrende Links:<\/p>\n\n\n\n<p>CRAN: <a href=\"https:\/\/cran.r-project.org\/web\/packages\/fhircrackr\/index.html\" target=\"_blank\" rel=\"noreferrer noopener\">https:\/\/cran.r-project.org\/web\/packages\/fhircrackr\/index.html <\/a><br>Github: <a href=\"https:\/\/github.com\/POLAR-fhiR\/fhircrackr\" target=\"_blank\" rel=\"noreferrer noopener\">https:\/\/github.com\/POLAR-fhiR\/fhircrackr<\/a><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Das von der Medizininformatik-Initiative (MII) festgelegte Datenformat HL7 FHIR Standard eignet sich optimal f\u00fcr interoperablen Datenaustausch und \u2013speicherung. Die M\u00f6glichkeiten statistischer Auswertung sind hingegen begrenzt. 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